1、慢性细菌性痢疾：常有急性细菌性痢疾病史，抗菌药物治疗有效，粪便培养可分离出痢疾病杆菌。

　　2、慢性阿米巴痢疾：病变主要侵犯右侧结肠，有散在性溃疡，溃疡较深，溃疡间的结肠粘膜多正常；粪便可找到阿米巴滋养体或包囊，抗阿米巴治疗有效。

　　3、局限性肠炎：病变主要侵犯回肠末端，腹痛多位于右下腹或脐周，里急后重少见，大便无粘液脓血，腹部肿块，瘘管形成，肛门直肠周围病灶较多见，粘膜活组织检查对鉴别诊断有帮助。

　　4、结肠癌：多见于中年以后，多数直肠癌于直肠指检时能触到肿块；结肠镜和X线钡剂灌肠检查对鉴别诊断有帮助，但要注意结肠癌与结肠炎并存。